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Poste CR INRAE -statistique des processus
Publiée le 19/12/2024 09:16.
Référence : INRAE-MISTEA.
CDI, Montpellier, UMR MISTEA.
Entreprise/Organisme :INRAE
Niveau d'études :Doctorat
Description :Un poste de CR (chercheuse/chercheur) INRAE devrait bientôt s'ouvrir dans l'unité MISTEA (Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie) du centre de Montpellier sur les "statistiques de processus"! Votre mission : l'étude et la mise en place de méthodes pour l’inférence et la calibration de modèles dynamiques aléatoires pour des données issues de capteur en élevage et agriculture. Ces modèles correspondent à des processus de Markov, de diffusion, de Markov cachés ou des modèles déterministes. Vous pourrez être amené·e à estimer des variables latentes, comme des ruptures ou des structures de mélange. L'inférence de ces modèles peut faire appel à des méthodes de statistique bayésienne, non-paramétriques ou de grande dimension. Pour améliorer la compréhension des agro-écosystèmes et fournir des outils numériques pour la décision, vous contribuerez à l'implémentation d'algorithmes stochastiques sur ces sujets à l'aide de méthodes d’apprentissage adaptées. Intéressé.e ? Rendez-vous sur le site INRAE Jobs dès le 28 janvier 2025 pour postuler ! https://jobs.inrae.fr/concours/concours-charges-recherche-classe-normale-profil-h-f Si vous voulez recevoir une notification par mail le jour J, n’hésitez pas à créer votre alerte emploi sur https://jobs.inrae.fr/formulaire-alerte-campagne Enfin, prenez contact avec Bertrand Cloez (bertrand.cloez@inrae.fr), responsable scientifique, ou Nadine Hilgert (nadine.hilgert@inrae.fr), directrice d'unité, dès l’ouverture de la campagne. Calendrier prévisionnel de la campagne : - Ouverture des inscriptions : 28 janvier 2025 - Clôture des inscriptions : 4 mars 2025 - Épreuve d'admissibilité : avril 2025 - Épreuve d'admission : du 2 au 18 juin - Prise de fonction : à partir du 1er septembre 2025
En savoir plus :https://jobs.inrae.fr/concours/concours-charges-recherche-classe-normale-profil-h-f
Contact :bertrand.cloez@inrae.fr
Les effets de l’instauration d’un jour de carence sur les absences pour maladie ordinaire des agents
Publiée le 19/12/2024 09:16.
Référence : Stage d’études économiques.
Stage, Cnam, 292 Rue Saint-Martin, 75003 Paris.
Entreprise/Organisme :Conservatoire national des Arts et Métiers (laboratoire MESuRS)
Niveau d'études :Master
Sujet :Les effets de l’instauration d’un jour de carence sur les absences pour maladie ordinaire des agents publics
Date de début :Mai 2025
Durée du contrat :5 à 6 mois
Rémunération :Gratification de stage
Secteur d'activité :Recherche / statistiques / économétrie
Description :Le stage a pour but de réaliser une étude économique sur l’évaluation, dans le secteur public, de deux réformes de janvier 2012 et 2018 modifiant l’étendue du remboursement des arrêts maladie dans la Fonction Publique française. Ces réformes instaurent un jour de carence supprimant l’indemnisation du premier jour du congé pour maladie ordinaire. Cette mesure est depuis discutée chaque année dans le débat public, mais son impact réel lors de sa période d’application n’a pas jusqu’alors été évalué économétriquement pour l’ensemble de la fonction publique.
En savoir plus :https://mesurs.cnam.fr/rejoindre-le-labo/
Contact :mohamed.benhalima@lecnam.net
Poste Ingénieur d’étude en bio-informatique
Publiée le 19/12/2024 09:16.
CDD, Rennes.
Entreprise/Organisme :EHESP/Leres
Niveau d'études :Master
Date de début :Mars 2025
Durée du contrat :24 mois
Secteur d'activité :Bio-informatique
Description :Depuis 2016, le Leres développe des approches analytiques innovantes reposant sur la spectrométrie de masse haute résolution (HRMS) pour mesurer l’exposition humaine aux contaminants chimiques de manière plus compréhensive. Les données générée sont massives et complexes et nécessitent le développement d’outils bioinformatiques performants.En ce sens, plusieurs outils bio-informatiques (Python) ont déjà été développés (https://github.com/scannotation) ou sont en cours de développement au laboratoire. Le poste proposé s’intègre dans le projet européen « Partenariat européen pour l'évaluation des risques liés aux produits chimiques (#EU_PARC) ». Ce projet majeur comprend 200 partenaires de 28 pays de l'UE : des agences nationales et des organismes de recherche travaillant dans les domaines de l'environnement ou de la santé publique, l'Agence européenne des produits chimiques (ECHA), l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) et l'Agence européenne pour l'environnement (AEE). L'objectif est de développer l'évaluation des risques chimiques de nouvelle génération afin de protéger la santé et l'environnement. L’ingénieur travaillera au Leres sur un sous-projet visant à développer un pipeline automatisé pour le retraitement des données HRMS. Plus précisément, l’ingénieur travaillera à implémenter les solutions bio-informatiques développées au Leres au sein d’un workflow dans l’environnement Galaxy. Le poste impliquera des présentations régulières des avancées en anglais au consortium Européen.
En savoir plus :https://www.sfbi.fr/emplois/offre/202412120501-cdd-poste-ingenieur-detude-en-bio-informatique
FDP IE bioinfo_projet EU PARC.pdf
Contact :arthur.david@ehesp.fr
M2 Research internship in mathematical statistics: Censored Deconvolution for relative survival.
Publiée le 19/12/2024 09:16.
Stage, Marseille.
Entreprise/Organisme :SESSTIM, Université Aix-Marseille
Niveau d'études :Master
Sujet :Context Survival analysis is a statistical theory targeted at the study of human lifetime. In particular, relative survival methodology deals with the case of datasets that do not contain the reason of death of the patients, this information (supposed binary: studied cause or other causes) being unavailable. This is often the case in large cancer studies extracted from cancer registries. The relative survival methodology [1], developed explicitly for this issue, is based on competing risks and considers the overall lifetime of patients as being the minimum between a populational survival time and an excess survival time. This is unfortunately not very practical to estimate the lost lifetime due to the disease, a key metric in the literature [2]. This internship explores new deconvolutional approaches to estimate the lost lifetime due to the disease. Objectives The main objective of the internship is to explore deconvolutional approaches in relative survival field targeted at direct estimation of the distribution of the lost lifetime w.r.t. the disease in a relative survival setup. A few different leads are already identified to propose non-parametric estimations procedures for this distribution: extending the work of [3] to a slightly different setup and/or the proposals in [4] are two of the potential directions to construct relevant estimators. We expect the development of theoretical results for the produced estimators, alongside small and large sample properties. The proposed work is part of the NetPlus project funded by the Cancéropôle PACA. Communication and publication of the results will be integral part of the work. Simulations and real data applications will be done in the –rising—Julia programing language. Upon success and common agreement, a follow-up through a 1-year contract is possible. Candidate’s profile The following are strictly required: - A master 2 level in mathematics, with majors in analysis, probability and statistics - Strong knowledge in mathematical modeling and theoretical statistics - Very good written English and programming skills, with good experience in latex and git Knowledges of standard survival analysis, deconvolutional statistics and the Julia programming language (which will be used for investigations) are not required but will be nice bonuses. Additional information - Length: 5 to 6 months, with a potential follow-up by a one-year engineer contract. - Location: At SESSTIM, on the Faculté des Sciences Médicales et Paramédicales in Marseille, France. - Wages: Regulatory internship stipend at the Université Aix-Marseille (4€35/hour for 35h/week, about 600€/month) - To apply: Please carefully read the announcement and review the references before applying. Then, please send your application with a resume and a few motivational lines by mail, with [Internship2025] in the subject, to oskar.laverny@univ-amu.fr. You can add link to previous scientific (unrelated) projects you did, if any. [1] M. Pohar Perme, J. Stare, et J. Estève, « On Estimation in Relative Survival », Biometrics, vol. 68, no 1, p. 113‑120, mars 2012, doi: 10.1111/j.1541-0420.2011.01640.x. [2] D. Manevski, N. Ružić Gorenjec, P. K. Andersen, et M. Pohar Perme, « Expected life years compared to the general population », Biomedical journal 2023, doi: 10.1002/bimj.202200070. [3] F. Comte, A. Samson, et J. J. Stirnemann, « Hazard estimation with censoring and measurement error: application to length of pregnancy », Test 2018, doi: 10.1007/s11749-017-0548-0. [4] I. Van Keilegom et E. Kekeç, « Estimation of the density for censored and contaminated data », Stat, vol. 13, no 1, p. e651, 2024, doi: 10.1002/sta4.651.
Durée du contrat :6 mois
Description :Stage de 5 à 6 mois en statistiques visant à la construction d'estimateurs déconvolutionels sous censure dans le champ de l'analyse de survie dite relative.
En savoir plus :https://sesstim.univ-amu.fr/sites/default/files/intership_offer_1.pdf
intership_offer.pdf
Contact :oskar.laverny@univ-amu.fr
Data scientist à l'ANSES -
Publiée le 19/12/2024 09:16.
Référence : Data scientist à l'ANSES -.
CDD, Sophia Antipolis (06) ou Maions-Alfort (94).
Entreprise/Organisme :ANSES
Niveau d'études :DUT/Licence ou équivalent
Date de début :1 juin 2025
Durée du contrat :30 mois
Rémunération :Selon l'expérience et la grille de l'ANSES
Secteur d'activité :Biologie/Ecotoxicologie
Description :Le projet WildPosh (Pan-european assessment, monitoring, and mitigation of chemical stressors on the health of wild pollinators) rassemble 17 partenaires de 10 pays européens. Il a pour principal objectif d’améliorer significativement l’évaluation du risque des pollinisateurs sauvages par rapport aux pesticides et d’améliorer la santé des pollinisateurs et du service de pollinisation en Europe. Dans le cadre d’une section du projet dédiée à la collecte de données, vous devrez créer un jeu de données portant sur l’usage des pesticides au niveau national et les données écotoxicologiques concernant les pollinisateurs, afin de définir des scenarios d’exposition et de toxicité. Au sein de l’Unité de Pathologie de l’Abeille et en lien avec la pilote de la tâche « Collection on ecotox end points », vous devrez chercher puis rassembler les données déjà existantes, disponibles sur différents supports (dans la littérature scientifique, dans des bases de données européennes ou nationales). Dans un second temps, vous devrez analyser statistiquement ces données afin de les décrire et d’en dégager des points forts et des axes d’amélioration.
En savoir plus :https://www.anses.fr/fr/content/data-scientist-hf
2024_Data_scientist_ANSES.pdf
Contact :marie-pierre.chauzat@anses.fr
Le processus de Hawkes : inférence Bayésienne, sélection de variable et application en épidémiologie
Publiée le 19/12/2024 09:16.
Stage, Centre de Recherche de Jouy-en-Josas.
Entreprise/Organisme :Université Paris-Saclay, INRAE , Unité MaIAGE
Niveau d'études :Master
Date de début :entre férvrier et avril 2025
Durée du contrat :5 à 6 mois
Rémunération :Selon la grille en vigueur
Description :Le processus de Hawkes est un modèle stochastique utilisé pour décrire des événements se produisant de manière séquentielle dans le temps, où chaque événement peut influencer la probabilité d'occurrence des événements futurs. En épidémiologie végétale, le processus de Hawkes permet de modéliser la propagation des maladies au sein des populations de plantes, en tenant compte des interactions complexes entre les agents pathogènes et les plantes hôtes. Dans le cadre de ce stage, il s'agit de construire un modèle prédictif de la propagation de la tavelure des pommiers, une maladie causée par le champignon Venturia Inaequalis qui libère des spores à intervalles irréguliers. Un modèle prédictif utilisant le processus de Hawkes enrichi par des covariables climatiques serait particulièrement intéressant car il permettrait de prévoir les dates de libération des spores en fonction de différents facteurs d’influence. En présence d’un grand nombre de covariables, il se pose la question de savoir s’il faut toutes les inclure et de comment gérer les défis classiques de la régression en grande dimension. La sélection d’un nombre restreint de covariables et la construction de modèles parcimonieux sont essentiels pour obtenir une bonne performance prédictive. Le travail de stage consistera à appliquer les méthodes d'inférence Bayesienne dans ce contexte.
En savoir plus :https://maiage.inrae.fr/
Sujet_M2_Hawkes_Covariates.pdf
Contact :katarzyna.adamczyk@inrae.fr
Modélisation statistique appliquée à la biomécanique
Publiée le 11/12/2024 21:08.
Référence : Stage de niveau M2/école ingénieur (5ème année).
Stage, Rennes (déplacements ponctuels à Lyon).
Entreprise/Organisme :INSA Lyon et Rennes
Niveau d'études :Master
Date de début :février/mars 2025
Durée du contrat :3 à 4 mois
Rémunération :gratification selon règlementation en vigueur
Secteur d'activité :enseignement supérieur
Description :Sujet en statistique appliquée à la biomécanique (cf sujet détaillé)
En savoir plus :https://dupuy.perso.math.cnrs.fr/
sujet_stage_INSA.pdf
Contact :jean-francois.dupuy@insa-rennes.fr
Stage/thèse en modélisation des sols
Publiée le 11/12/2024 11:14.
Référence : DeepHorizon.
Stage, Palaiseau.
Entreprise/Organisme :UMR MIA, AgroParisTech
Niveau d'études :Master
Sujet :Système d’inférence spatiale des sols avec incertitude quantifiée
Date de début :février 2025 ou plus tard
Durée du contrat :4 à 6 mois
Secteur d'activité :Recherche interdisciplinaire entre apprentissage statistique et science environnementales
Description :In the framework of the EU-project DeepHorizon (https://cordis.europa.eu/project/id/101156701), we are looking for an excellent PhD candidate to develop statistical methods supporting the development of a spatial soil inference system for European soils. A soil inference system uses known measurements, each with a certain level of uncertainty, to predict related soil properties with minimal error, by applying a series of logically connected (pedo)transfer functions (PTFs). The PhD candidate will start with an inventory of existing soil pedotransfer functions relevant to European soils and to calibrate usual mechanistic biogeochemical models. A large part of the work involves the exploration, development and application of new statistical approaches relevant for the inference system. The approaches should handle missing data along with uncertainty quantification of the input soil properties and propagation of the uncertainty throughout the inference engine. The candidate is expected to collaborate closely with other PhD candidates of the project consortium and with a project partner in Belgium, for which temporary stay could be envisioned. There is the possibility of a Master internship (4-6 months) on a sub-topic of the thesis.
En savoir plus :https://cordis.europa.eu/project/id/101156701
PhD_topic_PTFs.pdf
Contact :tabea.rebafka1@agroparistech.fr
PhD in modeling of soils
Publiée le 11/12/2024 11:14.
Référence : DeepHorizon.
Thèse, AgroParisTech , Palaiseau.
Entreprise/Organisme :UMR MIA, AgroParisTech
Niveau d'études :Master
Sujet :Developing a statistical spatial soil inference system with quantified uncertainty
Date de début :march 2025 or later
Durée du contrat :3 years
Rémunération :monthly gross salary ~ 2,100 €
Secteur d'activité :Interdisciplinary research in statistical machine learning and environmental sciences
Description :In the framework of the EU-project DeepHorizon (https://cordis.europa.eu/project/id/101156701), we are looking for an excellent PhD candidate to develop statistical methods supporting the development of a spatial soil inference system for European soils. A soil inference system uses known measurements, each with a certain level of uncertainty, to predict related soil properties with minimal error, by applying a series of logically connected (pedo)transfer functions (PTFs). The PhD candidate will start with an inventory of existing soil pedotransfer functions relevant to European soils and to calibrate usual mechanistic biogeochemical models. A large part of the work involves the exploration, development and application of new statistical approaches relevant for the inference system. The approaches should handle missing data along with uncertainty quantification of the input soil properties and propagation of the uncertainty throughout the inference engine. The candidate is expected to collaborate closely with other PhD candidates of the project consortium and with a project partner in Belgium, for which temporary stay could be envisioned.
En savoir plus :https://cordis.europa.eu/project/id/101156701
PhD_topic_PTFs.pdf
Contact :tabea.rebafka1@agroparistech.fr
Chercheur.se en épidémiologie et modélisation
Publiée le 11/12/2024 11:14.
Référence : Chercheur.se en épidémiologie et modélisation.
CDD, Ploufragan (Saint Brieuc, 22).
Entreprise/Organisme :Anses
Niveau d'études :Doctorat
Date de début :Avril 2025
Durée du contrat :4 ans
Secteur d'activité :Epidémiologie humaine/vétérinaire (One Health), sécurité alimentaire
Description :Le projet de recherche du candidat vise à développer des outils d'évaluation du risque de transfert de pathogènes du compartiment animal au compartiment humain (et vice-versa), afin de définir des mesures de maîtrise potentielles. Pour cela, le candidat s'attachera à produire les données nécessaires, réaliser des développements méthodologiques et coconstruire un programme d'enseignement niveau Master.
En savoir plus :NA
2024-177 Chercheur épidémiologie et modélisation One Health - F-A.pdf
Contact :nicolas.rose@anses.fr
Job offer: Postdoctoral Position in Applied Statistics in Social and Human Sciences at École Normale
Publiée le 11/12/2024 11:14.
Référence : Postdoctoral Position in Applied Statistics in Social and Human Sciences at École Normale.
Postdoc, Rennes.
Entreprise/Organisme :ENS Rennes
Niveau d'études :Doctorat
Date de début :Début 2025
Durée du contrat :2 ans (possibilité de renouvellement)
Rémunération :32'000 euros brut/an (négociable en fonction des expériences)
Description :The Department of Sport Sciences and Physical Education of the ENS Rennes is seeking a motivated postdoctoral researcher in Data Science to join the Youth Health From a Holistic Perspective (YEAH!) project, funded by the HORIZON research and innovation actions program. The YEAH! project aims to co-create an innovative intervention using digital solutions to promote social interactions that empower children and adolescents to make lifestyle choices that benefit their health and well-being. The intervention will be both personalized and designed to reach a large proportion of children and adolescents in the EU. We are seeking a researcher with strong data analysis skills to conduct systematic review and meta-analyses to identify socio-environmental, interpersonal, and individual determinants of youth health behaviors. The successful candidate will work under the supervision of Professor Boris Cheval and collaborate with other Horizon researchers specializing in large-scale data analysis.
En savoir plus :https://www.ens-rennes.fr/actualites/recrutements/postdoc-wp1
postdoc_wp1.pdf
Contact :boris.cheval@ens-rennes.fr
Stage M2 en biostatistique sur un projet de recherche clinique en réanimation cardio-thoracique
Publiée le 11/12/2024 11:14.
Référence : Stage IMPACT-ECMELLA-2025.
Stage, Montpellier.
Entreprise/Organisme :Institut Debrest d'Epidémiologie et de Santé Publique, INSERM, Université de Montpellier
Niveau d'études :Master
Sujet :Voir document pdf
Date de début :Février/mars 2025
Durée du contrat :Entre 4 et 6 mois
Description :Identification des caractéristiques cliniques et des facteurs de risque associés à l’escalade vers une ECMO-VA chez des patients en choc cardiogénique réfractaire initialement pris en charge par un soutien circulatoire mécanique par Impella
En savoir plus :https://idesp.umontpellier.fr
STAGE_ProjetIMPACT_2025.pdf
Contact :mailis.amico@umontpellier.fr
Modeling the cocktail effect in environmental impact computations
Publiée le 11/12/2024 11:14.
Thèse, Narbonne.
Entreprise/Organisme :INRAE
Niveau d'études :Doctorat
Sujet :See joined pdf
Date de début :Spring 2025
Durée du contrat :18 months
Rémunération :Between 2816€ and 3190€ gross depending on experience.
Description :See attached pdf
En savoir plus :https://eng-narbonne.montpellier.hub.inrae.fr/lbe/presentation
postdoc2024.pdf
Contact :remi.servien@inrae.fr
Censoring and Extreme Value Theory
Publiée le 11/12/2024 11:14.
Référence : Master 2 Internship + PhD.
Stage, IRMA, Université de Strasbourg.
Entreprise/Organisme :Université de Strasbourg
Niveau d'études :Master
Description :See attached file
En savoir plus :No link
Internship-Guillou-2025.pdf
Contact :armelle.guillou@math.unistra.fr
Biostatisticien(ne)
Publiée le 11/12/2024 11:14.
Référence : Laboratoire de Biologie Médicale Multi-site AURAGEN.
CDD, 5 Place d'Arsonval - 69003 LYON.
Entreprise/Organisme :GCS AURAGEN
Niveau d'études :Master
Date de début :Dès que possible
Durée du contrat :12 Mois - renouvelable en CDI
Rémunération :34 - 38k€ brut salarial - selon expérience et profil du candidat
Secteur d'activité :séquençage de génome à très haut débit
Description :La contribution attendue concerne la mise en place d’études et le développement de modèles statistiques pour le suivi longitudinal du contrôle de qualité des étapes humides du séquençage de l’ADN. Il s’agit de fournir des indicateurs de qualité à l’étape de production, de développer des modèles pour le suivi longitudinal de ces indicateurs, et d’analyser leurs déterminants. Des modèles log-linéaires généralisés à effet mixtes intégrant des fonctions souples (GAM, splines cubiques restreints) seront utilisés. Le / la biostatisticien(ne) en charge de ces analyses travaillera en collaboration avec les acteurs du laboratoire humide et les bioinformaticiens(nes) de la plateforme AURAGEN.
En savoir plus :NA
202411_Profil poste AURAGEN_BIOSTAT-VF.pdf
Contact :flore.matthieu@chu-lyon.fr

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